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從20世紀初至80年代，是化學藥物飛速發展的時代，在此期間，發現及發明了現在所使用的一些最重要的藥物，為人類健康做出了貢獻。
  從合成藥物發展的歷史及現今科學技術的進步來展望21世紀合成藥物發展的趨勢，可以從下列幾個方面加以評述。
  1、從藥用植物中發現新的先導化合物并進行結構修飾、發明新藥仍是21世紀合成新藥研究的重要部分。尤其是由于細胞及分子水平的活性篩選方法的常規化和分離技術的精巧化，有可能從植物中發現極微量的新的化學結構類型。同時，通過現代的篩選模型重新發現20世紀已經篩選過的植物化學成分的新用途，也為合成新藥研究提供了更多的成功機會。
  2、從天然來源發現新結構類型抗生素已經很困難，微生物對抗生素的耐藥性的增加，不合理的使用抗生素，使得一種抗生素的使用壽命愈來愈短。這種情況促使半合成及全合成抗生素在21世紀會得到特別發展。
  3、組合化學技術應用到獲得新化合物分子上，是仿生學的一種發展。它將一些基本小分子裝配成不同的組合，從而建立起具有大量化合物的化學分子庫，再結合高通量篩選來尋找到一些具有活性的先導化合物。
  4、有機化合物仍然是21世紀合成藥物最重要的來源。
  5、20世紀60~70年代，儀器分析（光譜、色譜）學科的逐漸形成，加快了化學合成藥物開發的速度，使化學藥物質量可控性達到相當完美的程度。進入21世紀，一批帶有高級計算機儀器的發明，分離、分析手段的不斷提高，特別是分析方法進一步的微量化等將使化學合成藥物的質量更加提高，開發速度也會進一步加快。
  6、藥理學進一步分枝化為分子藥理學、生化藥理學、免疫藥理學、受體藥理學等，使化學合成藥物的有效藥理表現更加具有特異性。21世紀，化學合成藥物會緊密地推動藥理學科的發展，藥理學的進展又會促進化學合成藥物向更加具有專一性的方向發展，使其不但具有更好的藥效，毒副作用也會更加減少。
  7、經過半個世紀的積累，通過利用計算機進行合理藥物設計的新藥研究和開發，展現出良好的發展前景。21世紀，酶、受體、蛋白的三維空間結構會一個一個地被闡明的，這給利用已闡明這些“生物靶點”進行合理藥物設計，從而開發出新的化學合成藥物奠定了堅實的基礎。
  8、防治心腦血管疾病、癌癥、病毒及艾滋病、老年性疾病、免疫及遺傳性等重要疾病的合成藥物是21世紀重點需要開發的新藥。
  9、分子生物學技術的突飛猛進、人類基因組學的研究成就，將對臨床用藥產生重大影響，不但會有助于發現一類新型微量內源性物質，如活性蛋白、細胞因子等藥物，也為化學合成藥物研究特別是提供新的作用靶點奠定了重要的基礎。
10、進入21世紀，化學合成藥物仍然是最有效、最常用、最大量及最重要的治療藥物。人類基因組學的研究成就、中藥現代化的巨大吸引力為我們帶來了美好的前景，引起了包括政府部門、企業家以及媒體的關心與興趣。將之作為重點科學事業給予支持與鼓勵，這是值得贊賞的，但是若因此而形成對化學合成藥物的忽視局面，甚至更多的渲染它的毒副作用，或用一些如“回歸自然”、“綠色消費”等動聽的名詞來貶低化學合成藥物的重要性和實用性，這是不全面的。當今世界大制藥公司新藥研究的主題仍是化學合成藥物。而利用人類基因組學及中藥現代化的成就開發出可以臨床使用的藥物并占有重要地位是一件十分困難的事業，需要相當時間的積累。假使說用化學方法合成藥物是今天該做的事，否則我們與國際水平相比將會有更大的差距。

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